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Il existe un grand nombre de protéines dans la nature (des dizaines de milliers) mais seules les protéines constituées des 22 acides aminés reconnues par notre code génétique sont assimilables et utilisables par notre corps. Dans la nature, on retrouve ces protéines dans les végétaux (principalement le soya et les pois) et les viandes animales que nous consommons (viandes rouges et blanches et dérivés comme le lait et aliments fabriqués à partir du lait). Généralement, les protéines sont quasiment absentes dans les fruits et les légumes où ne se retrouvent souvent que quelques acides aminés isolés, exception faites des légumineuses, parfois riches en acides aminés (glutamine) et même parfois en protéines (pois).

Par soucis de facilité, les athlètes des sports de force consomment des quantités élevées de protéine provenant de source animale comme les viandes, le lait (caséine et petit-lait) et l’albumine d’œuf. Les athlètes des sports pratiqués en anaérobie comme le bodybuilding (culturisme ou musculation), l’haltérophilie ou la force athlétique consomment des protéines sous formes alimentaires et en supplément car leur organisme a besoin d’une quantité plus élevée de protéines pour régénérer les muscles entraînés. Dans ces conditions, les glucides sont utilisés pour faire de l’énergie et pour assembler les acides aminés après l’exercice, en phase de récupération anabolisante.

Cependant, les athlètes des sports d’endurance ou collectifs ont également besoin de protéines, les processus de récupération étant généralement les mêmes que ceux des athlètes de la force ou du moins, ils présentent de fortes similarités, notamment sur le plan énergétique. En effet, une fois les réserves de glycogène épuisées, l’organisme commence à stocker dans ses stocks d’acides aminés pour refaire de l’énergie car les acides aminés peuvent être facilement convertis en sucres (sauf leucine et lysine). Certains acides aminés, notamment les acides aminés branchés (leucine, valine, isoleucine) peuvent parfaitement servir de source énergétique au cours de l’effort, surtout s’il se prolonge. Ce n’est seulement qu’après l’épuisement des réserves d’acides aminés que le corps commencera à puiser dans les graisses pour poursuivre la livraison d’énergie. Cela explique l’importance des acides aminés ; d’une part pour servir de source énergétique auxiliaire et d’autre part, pour faire barrage au catabolisme, l’utilisation des muscles pour alimenter l’organisme en énergie.

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